– في عام 1994 عيّن مسعود بزشكيان رئيسًا لجامعة تبريز للعلوم الطبية، واستمرت رئاسته حتى عام 2000.
– تولى منصب نائب وزير الصحة بوزارة الصحة والعلاج والتعليم الطبي، لمدة 6 أشهر في حكومة محمد خاتمي الأولى.
– في الولاية الثانية لرئاسة محمد خاتمي، شغل بزشكيان منصب وزير الصحة والعلاج والتعليم الطبي من 2001 إلى 2005، وبعد فترة تمت مساءلته من قبل البرلمان، ومن ثم ترك منصبه.
– منذ عام 2008، يمثّل مسعود بزشكيان مدينة تبريز في مجلس الشورى الإسلامي الإيراني.
– انتخب عام 2016 نائباً لمجلس الشورى الإسلامي الإيراني في دورته العاشرة التي كان يرأسها على لاريجاني.